近日，我校生命科學學院計算與整合生物學團隊在國際權(quán)威期刊《Journal of Advanced Research》（IF=11.4，綜合性一區(qū)Top）在線發(fā)表了題為 “Unlocking biological insights from differentially expressed genes: Concepts, methods, and future perspectives”的綜述論文。文章系統(tǒng)地闡述了差異表達基因集（DEGs）分析領域的最新研究進展、方法學及未來的發(fā)展趨勢，標志著我校在組學數(shù)據(jù)分析與生物信息學領域的研究再獲突破。
重慶師范大學為論文第一完成單位和唯一通訊單位。重慶師范大學-新橋醫(yī)院計算與神經(jīng)生物學聯(lián)合小組成員尹華春博士和我校生命科學學院2022級碩士研究生朵泓睿為第一作者，李勃副教授和郝友進教授為通訊作者，陸軍軍醫(yī)大學、美國東北大學、重慶郵電大學和浙江大學等單位的研究人員共同參與了此項工作。
隨著高通量組學技術(shù)的快速發(fā)展，差異表達基因集（DEGs）已成為理解復雜生物學過程、揭示重要疾病分子機制和開發(fā)精準醫(yī)學策略的最重要線索。然而，面對日益豐富的組學數(shù)據(jù)和多樣化的生物學問題，如何精準識別和解釋差異表達基因集仍存在諸多挑戰(zhàn)。在此背景下，文章從多個角度闡述了DEGs分析的理論和實踐問題，包括：如何從復雜的組學數(shù)據(jù)中精準提取差異表達基因，如何優(yōu)化算法以提高準確性和通用性，以及如何通過多組學整合實現(xiàn)生物學問題的全面解析等。同時，作者結(jié)合大規(guī)模文獻調(diào)研和研究經(jīng)驗，提出了多項改進策略和研究建議，并強調(diào)了人工智能和機器學習在復雜數(shù)據(jù)挖掘中的潛在價值。
研究人員表示，“差異表達基因集分析并非單一的生物信息學問題，它對生物學、醫(yī)學乃至生態(tài)學領域的研究均具有深遠影響。通過這篇綜述，我們希望為從事組學研究的學者提供清晰的思路和有效的理論和技術(shù)支持，同時也呼吁開發(fā)更具創(chuàng)新性的分析方法，推動這一領域持續(xù)向前發(fā)展?！痹撜撐牡陌l(fā)表不僅提升了我校在組學與生物信息學領域的學術(shù)聲譽，也為研究者理解和利用差異表達基因開辟了新的視角。
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